單細胞轉錄組產(chǎn)品
人基因組重測序可全面掃描人類基因組上的變異信息,一次性挖掘大量的生物標記物,該技術準確性高、可重復性好、定位精確,已被廣泛應用于疾病、癌癥的基因組研究。
10x Genomics單細胞轉錄組
利用油包水的微反應體系,通過序列標簽區(qū)別群體中的不同細胞,獲得單細胞水平的數(shù)字化基因表達譜,實現(xiàn)數(shù)千甚至數(shù)萬個單細胞群體分析。
SeekOne DD單細胞轉錄組
利用SeekOne?DD微流控平臺在單細胞水平上對 mRNA 進行高通量測序和分析,能獲得單個細胞內(nèi)基因表達信息,為辨別生物組織中各種細胞類型的轉錄組特征提供有力的工具。
10x Genomics單細胞基因表達Flex
不僅適配FFPE樣本,還能夠鎖定新鮮樣本的細胞狀態(tài),在不犧牲樣本完整性或數(shù)據(jù)質(zhì)量的情況下采集樣本、運輸?shù)街行膶嶒炇也㈤_展分析,打破了樣本限制,釋放各類樣本的單細胞研究潛能。
10x Genomics單細胞V(D)J
在單細胞水平同時實現(xiàn)免疫組庫分析(TCR和BCR)和5’端基因表達譜分析,在解析免疫組庫多樣性,探索T/B細胞特異性抗原,描述腫瘤微環(huán)境等研究中有廣泛應用。
10x Genomics單細胞GEM-X
以Chromium X平臺作為技術承載,推出單細胞基因表達(3’)v4版本和單細胞免疫組(5’)v3版本兩款產(chǎn)品,對單細胞轉錄組和單細胞免疫組庫各方面性能進行了全面升級。
單細胞全長轉錄組
可同時實現(xiàn)單細胞水平的基因表達定量和全長轉錄本可變剪切信息的獲取,為探索疾病發(fā)生發(fā)展的分子機制提供強大的技術支撐。
10x Genomics單細胞ATAC/多組學
可以同時獲得同一細胞的基因表達和染色質(zhì)可及性圖譜,提供同一細胞基因表達信息及其表觀基因組景觀的統(tǒng)一視圖;識別差異基因表達的驅動因素,揭示調(diào)控元件、開放染色質(zhì)和基因表達之間復雜的相互作用。
應用方向
- 組織圖譜:繪制不同器官和組織的細胞圖譜;有助于理解健康和疾病狀態(tài)下的細胞組成和功能;
- 發(fā)育分化:監(jiān)測發(fā)育不同階段的細胞轉錄活動,對于理解組織發(fā)育和再生、以及干細胞科學至關重要;
- 腫瘤研究:識別和分類腫瘤內(nèi)的異質(zhì)細胞群體,包括癌細胞和腫瘤微環(huán)境中的其他細胞類型(如免疫細胞),有助于揭示腫瘤的發(fā)展、擴散機制以及對治療的響應;
- 免疫研究:在單細胞層面上詳細分析免疫細胞的狀態(tài)和功能,識別不同的免疫細胞亞型和它們在免疫反應中的作用,對于開發(fā)針對感染、炎癥以及自身免疫疾病的新療法具有重要意義;
案例解析
人和小鼠HCC癌癥相關成纖維細胞圖譜
單細胞測序揭示癌相關成纖維細胞為肝細胞癌提供免疫抑制微環(huán)境
肝細胞癌(HCC)是一種具有高度細胞異質(zhì)性的惡性腫瘤。該研究利用單細胞轉錄組測序技術分別對人和小鼠的肝細胞癌腫瘤免疫微環(huán)境進行高精度觀測,在單細胞水平上系統(tǒng)全面地繪制了人和小鼠HCC癌癥相關成纖維細胞(CAFs)圖譜及亞群特征。并確定了CD36在CD36+CAFs中通過脂質(zhì)過氧化/p38/CEBPs軸介導氧化性LDL攝取依賴的MIF表達,進而促進免疫抑制性腫瘤微環(huán)境的形成以及腫瘤細胞的擴增等。并且,作者通過一系列的驗證,揭示靶向CD36可有效提高免疫治療的療效。該研究不僅深入地挖掘了腫瘤相關成纖維細胞關鍵亞型在促腫瘤過程中的分子機制,還為克服免疫抑制性腫瘤微環(huán)境、提高臨床免疫治療及細胞治療療效提供了堅實的數(shù)據(jù)支撐。
參考文獻:Zhu G Q, Tang Z, Huang R. et al. CD36+ cancer-associated fibroblasts provide immunosuppressive microenvironment for hepatocellular carcinoma via secretion of macrophage migration inhibitory factor [J]. Cell Discovery. 2023 Mar 6;9(1):25.